Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RNF17Q9BXT8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RNF17Q9BXT8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms