Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C9orf85Q96MD7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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