Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zbed4Q80WQ9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zbed4Q80WQ9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zbed4Q80WQ9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zbed4Q80WQ9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zbed4Q80WQ9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zbed4Q80WQ9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zbed4Q80WQ9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zbed4Q80WQ9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zbed4Q80WQ9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zbed4Q80WQ9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zbed4Q80WQ9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zbed4Q80WQ9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zbed4Q80WQ9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms