Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
STRCQ7RTU9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
STRCQ7RTU9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms