Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZBED9Q6R2W3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ZBED9Q6R2W3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms