Protein–RNA interactions for Protein: Q64124

Scx, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScxQ64124 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScxQ64124 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ScxQ64124 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ScxQ64124 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ScxQ64124 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ScxQ64124 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ScxQ64124 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
ScxQ64124 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ScxQ64124 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ScxQ64124 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ScxQ64124 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ScxQ64124 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ScxQ64124 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ScxQ64124 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
ScxQ64124 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ScxQ64124 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScxQ64124 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScxQ64124 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScxQ64124 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScxQ64124 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScxQ64124 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScxQ64124 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScxQ64124 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScxQ64124 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScxQ64124 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ScxQ64124 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScxQ64124 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ScxQ64124 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScxQ64124 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ScxQ64124 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScxQ64124 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScxQ64124 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScxQ64124 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ScxQ64124 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScxQ64124 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScxQ64124 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScxQ64124 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScxQ64124 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScxQ64124 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScxQ64124 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScxQ64124 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ScxQ64124 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ScxQ64124 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScxQ64124 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScxQ64124 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScxQ64124 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ScxQ64124 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScxQ64124 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ScxQ64124 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms