Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Syndig1lQ3USQ7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms