Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNW1Q13573 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms