Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nhlh1Q02576 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nhlh1Q02576 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms