Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SeboxP70368 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SeboxP70368 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SeboxP70368 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SeboxP70368 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SeboxP70368 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SeboxP70368 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SeboxP70368 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SeboxP70368 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SeboxP70368 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SeboxP70368 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SeboxP70368 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SeboxP70368 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SeboxP70368 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SeboxP70368 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SeboxP70368 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SeboxP70368 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SeboxP70368 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SeboxP70368 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SeboxP70368 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SeboxP70368 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SeboxP70368 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeboxP70368 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeboxP70368 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeboxP70368 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeboxP70368 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SeboxP70368 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SeboxP70368 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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