Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RARRES1P49788 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RARRES1P49788 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms