Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC1A4P43007 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC1A4P43007 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms