Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnkO88874 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnkO88874 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnkO88874 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnkO88874 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnkO88874 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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CcnkO88874 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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CcnkO88874 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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CcnkO88874 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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CcnkO88874 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnkO88874 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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CcnkO88874 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnkO88874 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnkO88874 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnkO88874 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CcnkO88874 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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