Protein–RNA interactions for Protein: O08542

Efna4, Ephrin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna4O08542 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna4O08542 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna4O08542 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna4O08542 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna4O08542 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efna4O08542 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efna4O08542 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efna4O08542 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efna4O08542 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efna4O08542 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efna4O08542 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efna4O08542 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efna4O08542 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efna4O08542 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efna4O08542 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efna4O08542 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna4O08542 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna4O08542 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna4O08542 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna4O08542 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna4O08542 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna4O08542 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna4O08542 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna4O08542 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna4O08542 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna4O08542 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna4O08542 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna4O08542 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna4O08542 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna4O08542 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna4O08542 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efna4O08542 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna4O08542 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna4O08542 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna4O08542 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna4O08542 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna4O08542 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna4O08542 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna4O08542 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna4O08542 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna4O08542 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna4O08542 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna4O08542 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna4O08542 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna4O08542 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna4O08542 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna4O08542 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna4O08542 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna4O08542 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna4O08542 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna4O08542 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna4O08542 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna4O08542 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Efna4O08542 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms