Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21900J3QP38 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21900J3QP38 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21900J3QP38 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21900J3QP38 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21900J3QP38 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21900J3QP38 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm21900J3QP38 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21900J3QP38 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21900J3QP38 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21900J3QP38 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21900J3QP38 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21900J3QP38 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21900J3QP38 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21900J3QP38 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21900J3QP38 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21900J3QP38 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21900J3QP38 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21900J3QP38 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21900J3QP38 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21900J3QP38 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21900J3QP38 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21900J3QP38 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21900J3QP38 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21900J3QP38 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21900J3QP38 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21900J3QP38 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21900J3QP38 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21900J3QP38 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21900J3QP38 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21900J3QP38 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21900J3QP38 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm21900J3QP38 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm21900J3QP38 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm21900J3QP38 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm21900J3QP38 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21900J3QP38 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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