Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00862A6NCI5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00862A6NCI5 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms