Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LHX3Q9UBR4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHX3Q9UBR4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LHX3Q9UBR4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LHX3Q9UBR4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms