Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHPF2Q9P2E5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHPF2Q9P2E5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms