Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NRIP3Q9NQ35 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NRIP3Q9NQ35 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms