Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PUS3Q9BZE2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PUS3Q9BZE2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms