Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SSBP4Q9BWG4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms