Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Def8Q99J78 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Def8Q99J78 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Def8Q99J78 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Def8Q99J78 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Def8Q99J78 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Def8Q99J78 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Def8Q99J78 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Def8Q99J78 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Def8Q99J78 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Def8Q99J78 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Def8Q99J78 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Def8Q99J78 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Def8Q99J78 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Def8Q99J78 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Def8Q99J78 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Def8Q99J78 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Def8Q99J78 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Def8Q99J78 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Def8Q99J78 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Def8Q99J78 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Def8Q99J78 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Def8Q99J78 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Def8Q99J78 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Def8Q99J78 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Def8Q99J78 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Def8Q99J78 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Def8Q99J78 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Def8Q99J78 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Def8Q99J78 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Def8Q99J78 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Def8Q99J78 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Def8Q99J78 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Def8Q99J78 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Def8Q99J78 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Def8Q99J78 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Def8Q99J78 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Def8Q99J78 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Def8Q99J78 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Def8Q99J78 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Def8Q99J78 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Def8Q99J78 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Def8Q99J78 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Def8Q99J78 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Def8Q99J78 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Def8Q99J78 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms