Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf183Q8QZS5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf183Q8QZS5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf183Q8QZS5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf183Q8QZS5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf183Q8QZS5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf183Q8QZS5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf183Q8QZS5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf183Q8QZS5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Rnf183Q8QZS5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rnf183Q8QZS5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rnf183Q8QZS5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Rnf183Q8QZS5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rnf183Q8QZS5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rnf183Q8QZS5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rnf183Q8QZS5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rnf183Q8QZS5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf183Q8QZS5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rnf183Q8QZS5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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