Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATG16L2Q8NAA4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATG16L2Q8NAA4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L2Q8NAA4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L2Q8NAA4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L2Q8NAA4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L2Q8NAA4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L2Q8NAA4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L2Q8NAA4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L2Q8NAA4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L2Q8NAA4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L2Q8NAA4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L2Q8NAA4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L2Q8NAA4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L2Q8NAA4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L2Q8NAA4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L2Q8NAA4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L2Q8NAA4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L2Q8NAA4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L2Q8NAA4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L2Q8NAA4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L2Q8NAA4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L2Q8NAA4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L2Q8NAA4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L2Q8NAA4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L2Q8NAA4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L2Q8NAA4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L2Q8NAA4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L2Q8NAA4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L2Q8NAA4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L2Q8NAA4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATG16L2Q8NAA4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG16L2Q8NAA4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG16L2Q8NAA4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG16L2Q8NAA4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG16L2Q8NAA4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG16L2Q8NAA4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG16L2Q8NAA4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG16L2Q8NAA4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG16L2Q8NAA4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATG16L2Q8NAA4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms