Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ttc29Q80VM3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ttc29Q80VM3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ttc29Q80VM3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ttc29Q80VM3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ttc29Q80VM3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ttc29Q80VM3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ttc29Q80VM3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Ttc29Q80VM3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ttc29Q80VM3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttc29Q80VM3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Ttc29Q80VM3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttc29Q80VM3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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