Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1W4

LRRC8D, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8D, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8DQ7L1W4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC8DQ7L1W4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms