Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Scaf4Q6PFF0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms