Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lcn3Q62471 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn3Q62471 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms