Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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PtprnQ60673 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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PtprnQ60673 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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PtprnQ60673 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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PtprnQ60673 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PtprnQ60673 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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PtprnQ60673 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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PtprnQ60673 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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PtprnQ60673 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprnQ60673 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms