Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tsr1Q5SWD9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tsr1Q5SWD9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms