Protein–RNA interactions for Protein: Q12378

RTR2, RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RTR2, yeastyeast

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTR2Q12378 YBR032WYBR032W 303 nt0.42□□□□□ -2.34
RTR2Q12378 ULP2YIL031W 3105 nt0.42□□□□□ -2.34
RTR2Q12378 PRP16YKR086W 3216 nt0.42□□□□□ -2.34
RTR2Q12378 NDD1YOR372C 1665 nt0.41□□□□□ -2.34
RTR2Q12378 MAM1YER106W 909 nt0.41□□□□□ -2.34
RTR2Q12378 CCE1YKL011C 1062 nt0.41□□□□□ -2.34
RTR2Q12378 RPL9BYNL067W 576 nt0.41□□□□□ -2.34
RTR2Q12378 LST4YKL176C 2487 nt0.41□□□□□ -2.34
RTR2Q12378 CGI121YML036W 546 nt0.4□□□□□ -2.35
RTR2Q12378 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt0.4□□□□□ -2.35
RTR2Q12378 YMR321CYMR321C 318 nt0.4□□□□□ -2.35
RTR2Q12378 FMP23YBR047W 528 nt0.4□□□□□ -2.35
RTR2Q12378 YCL046WYCL046W 324 nt0.4□□□□□ -2.35
RTR2Q12378 AI1Q0050 2505 nt0.39□□□□□ -2.35
RTR2Q12378 FMP27YLR454W 7887 nt0.39□□□□□ -2.35
RTR2Q12378 MXR1YER042W 555 nt0.39□□□□□ -2.35
RTR2Q12378 DUO1YGL061C 744 nt0.39□□□□□ -2.35
RTR2Q12378 PFS1YHR185C 714 nt0.39□□□□□ -2.35
RTR2Q12378 YKL115CYKL115C 393 nt0.39□□□□□ -2.35
RTR2Q12378 YET2YMR040W 483 nt0.39□□□□□ -2.35
RTR2Q12378 IRC14YOR135C 342 nt0.39□□□□□ -2.35
RTR2Q12378 YBR062CYBR062C 543 nt0.39□□□□□ -2.35
RTR2Q12378 YDR262WYDR262W 819 nt0.38□□□□□ -2.35
RTR2Q12378 MIC19YFR011C 513 nt0.38□□□□□ -2.35
RTR2Q12378 YLR031WYLR031W 561 nt0.38□□□□□ -2.35
RTR2Q12378 COX8YLR395C 237 nt0.38□□□□□ -2.35
RTR2Q12378 IZH4YOL101C 939 nt0.38□□□□□ -2.35
RTR2Q12378 TOF2YKR010C 2316 nt0.37□□□□□ -2.35
RTR2Q12378 SLS1YLR139C 1932 nt0.37□□□□□ -2.35
RTR2Q12378 YIL059CYIL059C 366 nt0.37□□□□□ -2.35
RTR2Q12378 UBX4YMR067C 1251 nt0.37□□□□□ -2.35
RTR2Q12378 GPX2YBR244W 489 nt0.37□□□□□ -2.35
RTR2Q12378 YLL007CYLL007C 1998 nt0.37□□□□□ -2.35
RTR2Q12378 YSP1YHR155W 3687 nt0.37□□□□□ -2.35
RTR2Q12378 DPB11YJL090C 2295 nt0.36□□□□□ -2.35
RTR2Q12378 RIM20YOR275C 1986 nt0.36□□□□□ -2.35
RTR2Q12378 snR57snR57 88 nt0.36□□□□□ -2.35
RTR2Q12378 SWF1YDR126W 1011 nt0.36□□□□□ -2.35
RTR2Q12378 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt0.36□□□□□ -2.35
RTR2Q12378 IST3YIR005W 447 nt0.36□□□□□ -2.35
RTR2Q12378 RFA3YJL173C 369 nt0.36□□□□□ -2.35
RTR2Q12378 LTE1YAL024C 4308 nt0.35□□□□□ -2.35
RTR2Q12378 SVP26YHR181W 687 nt0.35□□□□□ -2.35
RTR2Q12378 BMT5YIL096C 1011 nt0.35□□□□□ -2.35
RTR2Q12378 DDR48YMR173W 1293 nt0.35□□□□□ -2.35
RTR2Q12378 YPL034WYPL034W 498 nt0.35□□□□□ -2.35
RTR2Q12378 RTC6YPL183W-A 282 nt0.35□□□□□ -2.35
RTR2Q12378 YBR224WYBR224W 516 nt0.35□□□□□ -2.35
RTR2Q12378 BRO1YPL084W 2535 nt0.34□□□□□ -2.35
RTR2Q12378 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt0.33□□□□□ -2.36
RTR2Q12378 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt0.33□□□□□ -2.36
RTR2Q12378 YDL009CYDL009C 324 nt0.32□□□□□ -2.36
RTR2Q12378 YDL196WYDL196W 330 nt0.32□□□□□ -2.36
RTR2Q12378 ECM12YHR021W-A 456 nt0.32□□□□□ -2.36
RTR2Q12378 YBR051WYBR051W 351 nt0.32□□□□□ -2.36
RTR2Q12378 SVS1YPL163C 783 nt0.32□□□□□ -2.36
RTR2Q12378 LYS14YDR034C 2373 nt0.32□□□□□ -2.36
RTR2Q12378 YER147C-AYER147C-A 411 nt0.31□□□□□ -2.36
RTR2Q12378 YDL206WYDL206W 2289 nt0.31□□□□□ -2.36
RTR2Q12378 BIR1YJR089W 2865 nt0.3□□□□□ -2.36
RTR2Q12378 KEG1YFR042W 603 nt0.3□□□□□ -2.36
RTR2Q12378 YGL109WYGL109W 324 nt0.3□□□□□ -2.36
RTR2Q12378 YGR265WYGR265W 411 nt0.3□□□□□ -2.36
RTR2Q12378 SMD2YLR275W 333 nt0.3□□□□□ -2.36
RTR2Q12378 RUF20RUF20 443 nt0.3□□□□□ -2.36
RTR2Q12378 YBR012CYBR012C 420 nt0.3□□□□□ -2.36
RTR2Q12378 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.3□□□□□ -2.36
RTR2Q12378 PIG1YLR273C 1947 nt0.29□□□□□ -2.36
RTR2Q12378 YGR242WYGR242W 309 nt0.29□□□□□ -2.36
RTR2Q12378 YJR071WYJR071W 369 nt0.29□□□□□ -2.36
RTR2Q12378 PEP3YLR148W 2757 nt0.29□□□□□ -2.36
RTR2Q12378 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt0.28□□□□□ -2.36
RTR2Q12378 RPS10BYMR230W 318 nt0.28□□□□□ -2.36
RTR2Q12378 ROX1YPR065W 1107 nt0.28□□□□□ -2.36
RTR2Q12378 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.28□□□□□ -2.36
RTR2Q12378 GEP7YGL057C 864 nt0.27□□□□□ -2.37
RTR2Q12378 UFE1YOR075W 1041 nt0.27□□□□□ -2.37
RTR2Q12378 YOR105WYOR105W 327 nt0.27□□□□□ -2.37
RTR2Q12378 MPT5YGL178W 2580 nt0.27□□□□□ -2.37
RTR2Q12378 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.26□□□□□ -2.37
RTR2Q12378 PAN2YGL094C 3348 nt0.26□□□□□ -2.37
RTR2Q12378 YGR045CYGR045C 363 nt0.26□□□□□ -2.37
RTR2Q12378 PHO80YOL001W 882 nt0.26□□□□□ -2.37
RTR2Q12378 IQG1YPL242C 4488 nt0.25□□□□□ -2.37
RTR2Q12378 RAD6YGL058W 519 nt0.25□□□□□ -2.37
RTR2Q12378 ABF2YMR072W 552 nt0.25□□□□□ -2.37
RTR2Q12378 ATP15YPL271W 189 nt0.25□□□□□ -2.37
RTR2Q12378 SLM6YBR266C 453 nt0.25□□□□□ -2.37
RTR2Q12378 NUT1YGL151W 3399 nt0.25□□□□□ -2.37
RTR2Q12378 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.24□□□□□ -2.37
RTR2Q12378 POP6YGR030C 477 nt0.24□□□□□ -2.37
RTR2Q12378 YGR290WYGR290W 444 nt0.24□□□□□ -2.37
RTR2Q12378 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt0.24□□□□□ -2.37
RTR2Q12378 YLR042CYLR042C 486 nt0.24□□□□□ -2.37
RTR2Q12378 GMC2YLR445W 567 nt0.24□□□□□ -2.37
RTR2Q12378 YOR199WYOR199W 330 nt0.24□□□□□ -2.37
RTR2Q12378 NUT2YPR168W 474 nt0.24□□□□□ -2.37
RTR2Q12378 PEX34YCL056C 435 nt0.24□□□□□ -2.37
RTR2Q12378 IES4YOR189W 351 nt0.23□□□□□ -2.37
RTR2Q12378 CHZ1YER030W 462 nt0.22□□□□□ -2.37
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