Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMOD3Q0VAK6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms