Protein–RNA interactions for Protein: P35282

Rab21, Ras-related protein Rab-21, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab21P35282 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab21P35282 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab21P35282 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab21P35282 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab21P35282 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab21P35282 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab21P35282 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab21P35282 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab21P35282 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab21P35282 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab21P35282 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab21P35282 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms