Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL3P10147 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL3P10147 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL3P10147 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL3P10147 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL3P10147 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL3P10147 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL3P10147 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL3P10147 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL3P10147 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL3P10147 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL3P10147 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL3P10147 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL3P10147 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL3P10147 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL3P10147 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL3P10147 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL3P10147 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL3P10147 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL3P10147 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL3P10147 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL3P10147 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL3P10147 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL3P10147 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL3P10147 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL3P10147 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL3P10147 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL3P10147 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL3P10147 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL3P10147 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL3P10147 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL3P10147 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL3P10147 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL3P10147 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL3P10147 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL3P10147 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL3P10147 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL3P10147 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL3P10147 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL3P10147 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL3P10147 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL3P10147 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCL3P10147 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL3P10147 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL3P10147 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL3P10147 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL3P10147 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL3P10147 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL3P10147 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL3P10147 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL3P10147 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL3P10147 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL3P10147 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL3P10147 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL3P10147 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL3P10147 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL3P10147 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL3P10147 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL3P10147 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL3P10147 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL3P10147 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL3P10147 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL3P10147 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL3P10147 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL3P10147 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCL3P10147 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL3P10147 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL3P10147 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL3P10147 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL3P10147 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL3P10147 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL3P10147 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL3P10147 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL3P10147 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL3P10147 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL3P10147 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL3P10147 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL3P10147 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL3P10147 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL3P10147 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL3P10147 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL3P10147 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL3P10147 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL3P10147 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL3P10147 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL3P10147 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL3P10147 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL3P10147 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL3P10147 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL3P10147 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL3P10147 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCL3P10147 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCL3P10147 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCL3P10147 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCL3P10147 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL3P10147 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL3P10147 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL3P10147 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL3P10147 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCL3P10147 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms