Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NlkO54949 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NlkO54949 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NlkO54949 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NlkO54949 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NlkO54949 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NlkO54949 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NlkO54949 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NlkO54949 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NlkO54949 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NlkO54949 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NlkO54949 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NlkO54949 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NlkO54949 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NlkO54949 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NlkO54949 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NlkO54949 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NlkO54949 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NlkO54949 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NlkO54949 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NlkO54949 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NlkO54949 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NlkO54949 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NlkO54949 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NlkO54949 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NlkO54949 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NlkO54949 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NlkO54949 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NlkO54949 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NlkO54949 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NlkO54949 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NlkO54949 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NlkO54949 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NlkO54949 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NlkO54949 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NlkO54949 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NlkO54949 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NlkO54949 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NlkO54949 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NlkO54949 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NlkO54949 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NlkO54949 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NlkO54949 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NlkO54949 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NlkO54949 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NlkO54949 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NlkO54949 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NlkO54949 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NlkO54949 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NlkO54949 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NlkO54949 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NlkO54949 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NlkO54949 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NlkO54949 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NlkO54949 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NlkO54949 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NlkO54949 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NlkO54949 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NlkO54949 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NlkO54949 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NlkO54949 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NlkO54949 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NlkO54949 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NlkO54949 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NlkO54949 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NlkO54949 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NlkO54949 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NlkO54949 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NlkO54949 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NlkO54949 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NlkO54949 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NlkO54949 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NlkO54949 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NlkO54949 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NlkO54949 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NlkO54949 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NlkO54949 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NlkO54949 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NlkO54949 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NlkO54949 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NlkO54949 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NlkO54949 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NlkO54949 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NlkO54949 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NlkO54949 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NlkO54949 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NlkO54949 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NlkO54949 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NlkO54949 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NlkO54949 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NlkO54949 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NlkO54949 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NlkO54949 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NlkO54949 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NlkO54949 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NlkO54949 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NlkO54949 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NlkO54949 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NlkO54949 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NlkO54949 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms