Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CrxO54751 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CrxO54751 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CrxO54751 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CrxO54751 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CrxO54751 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CrxO54751 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CrxO54751 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CrxO54751 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CrxO54751 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CrxO54751 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CrxO54751 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CrxO54751 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CrxO54751 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CrxO54751 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CrxO54751 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CrxO54751 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CrxO54751 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CrxO54751 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CrxO54751 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CrxO54751 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
CrxO54751 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
CrxO54751 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CrxO54751 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CrxO54751 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CrxO54751 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CrxO54751 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CrxO54751 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CrxO54751 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CrxO54751 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CrxO54751 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CrxO54751 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CrxO54751 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CrxO54751 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CrxO54751 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CrxO54751 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CrxO54751 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CrxO54751 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CrxO54751 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrxO54751 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrxO54751 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrxO54751 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrxO54751 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrxO54751 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrxO54751 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrxO54751 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrxO54751 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrxO54751 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrxO54751 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrxO54751 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrxO54751 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrxO54751 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrxO54751 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrxO54751 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrxO54751 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrxO54751 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrxO54751 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrxO54751 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrxO54751 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrxO54751 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrxO54751 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrxO54751 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrxO54751 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrxO54751 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrxO54751 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CrxO54751 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CrxO54751 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CrxO54751 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CrxO54751 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CrxO54751 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CrxO54751 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CrxO54751 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CrxO54751 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CrxO54751 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CrxO54751 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CrxO54751 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CrxO54751 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CrxO54751 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CrxO54751 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CrxO54751 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CrxO54751 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CrxO54751 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CrxO54751 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CrxO54751 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CrxO54751 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CrxO54751 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CrxO54751 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CrxO54751 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrxO54751 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrxO54751 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrxO54751 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrxO54751 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrxO54751 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrxO54751 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrxO54751 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrxO54751 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrxO54751 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrxO54751 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrxO54751 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CrxO54751 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms