Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DYNC1LI2O43237 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms