Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc27a2O35488 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms