Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Eftud2O08810 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Eftud2O08810 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms