Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tmem238A9JSM3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmem238A9JSM3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms