Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcf1Q9QZM3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms