Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 292.5 ms