Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIN6

Kcnmb4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb4Q9JIN6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Kcnmb4Q9JIN6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms