Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IFIH1Q9BYX4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms