Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sf3b4Q8QZY9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sf3b4Q8QZY9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms