Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab11fip3Q8CHD8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab11fip3Q8CHD8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms