Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ScocQ78YZ6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ScocQ78YZ6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ScocQ78YZ6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ScocQ78YZ6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms