Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usf2Q64705 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms