Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rbm38Q62176 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rbm38Q62176 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rbm38Q62176 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
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