Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
XKR3Q5GH77 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
XKR3Q5GH77 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms